بررسی چند شکلی DNA در جمعیت های AG-۴ Rhizoctonia solani با استفاده از نشانگر مولکولی rDNA RFLP
عنوان مقاله: بررسی چند شکلی DNA در جمعیت های AG-۴ Rhizoctonia solani با استفاده از نشانگر مولکولی rDNA RFLP
شناسه ملی مقاله: JR_RPPM-5-1_002
منتشر شده در در سال 1396
شناسه ملی مقاله: JR_RPPM-5-1_002
منتشر شده در در سال 1396
مشخصات نویسندگان مقاله:
فرزانه بادپا - دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه زیست شناسی، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران.
غلامرضا بلالی - دانشیار، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران.
بهرام شریف نبی - استاد، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان، ایران
خلاصه مقاله:
فرزانه بادپا - دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه زیست شناسی، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران.
غلامرضا بلالی - دانشیار، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران.
بهرام شریف نبی - استاد، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان، ایران
توالیهای DNA ریبوزومی بهدلیل اینکه دارای کپیهای زیادی از ژنهای rRNA و نیز درجه بالایی از تغییر میباشند، بهمنظور بررسی روابط فیلوژنی در محدوده وسیعی از سطوح تاکسونومی مورد استفاده قرار میگیرند. نواحی ITS و فواصل داخل ژنی DNA ریبوزومی هستهای، واحدهای تکراری تکامل یافته ثابت میباشند و ممکن است در بین گونه های داخل یک جنس یا در بین افراد یک جمعیت متغیر باشند. بهمنظور ارزیابی چند شکلی نواحی حد فاصل ژنهای s۲۸ و s۱۸ در ژنوم قارچ Rhizoctonia solani گروه آناستوموزی ۴ (AG-۴)، ۲۸جدایه از میزبانهای مختلف مورد ارزیابی قرار گرفتند. از جدایهها DNA استخراج و از آنها به عنوان الگو در واکنشهای PCR استفاده شد. در تکثیر نواحی فاصلهساز داخلی بین ژنهای ریبوزومی با استفاده از آغازگرهای ITS۱ و ITS۴ یک قطعه DNA به اندازه ۷۰۰ جفت باز ردیابی شد. قطعه مذکور با آنزیمهای برشیTaq I Xba I, Hae III, Bam HI, Hind III, Sac I, Pst I, Nde I, Xho I, Hinc II, Hinf I, Eco RI, هضم شد. ولی آنزیمهای Xba I, Bam HI, Hind III, Sac I, Pst I, Nde I, Xho I فاقد محل برش بودند. نتایج حاصله نشان داد که جدایههای Rhizoctonia solani AG۴ هتروژن بوده و ITS-RFLP با استفاده از آنزیم Hinc II تفاوت بین زیرگروههای AG۴-HG I و AG۴-HG II رااز نظر الگوی برش آنزیمی نشان داد.
کلمات کلیدی: genetic diversity, ITS-rDNA, PCR, Rhizoctonia solani AG۴
صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1907887/