CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

بررسی چند شکلی DNA در جمعیت های AG-۴ Rhizoctonia solani با استفاده از نشانگر مولکولی rDNA RFLP

عنوان مقاله: بررسی چند شکلی DNA در جمعیت های AG-۴ Rhizoctonia solani با استفاده از نشانگر مولکولی rDNA RFLP
شناسه ملی مقاله: JR_RPPM-5-1_002
منتشر شده در در سال 1396
مشخصات نویسندگان مقاله:

فرزانه بادپا - دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه زیست شناسی، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران.
غلامرضا بلالی - دانشیار، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران.
بهرام شریف نبی - استاد، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان، ایران

خلاصه مقاله:
توالی­های DNA ریبوزومی به­دلیل اینکه دارای کپی­های زیادی از ژن­های rRNA و نیز درجه بالایی از تغییر می­باشند، به­منظور بررسی روابط فیلوژنی در محدوده وسیعی از سطوح تاکسونومی مورد استفاده قرار می­گیرند. نواحی ITS و فواصل داخل ژنی DNA ریبوزومی هسته­ای، واحد­های تکراری تکامل یافته ثابت می­باشند و ممکن است در بین گونه های داخل یک جنس یا در بین افراد یک جمعیت متغیر باشند. به­منظور ارزیابی چند شکلی نواحی حد فاصل ژن­های s۲۸ و s۱۸ در ژنوم قارچ Rhizoctonia solani  گروه آناستوموزی ۴ (AG-۴)، ۲۸جدایه از میزبان­های مختلف مورد ارزیابی قرار گرفتند. از جدایه­ها DNA استخراج و از آن­ها به عنوان الگو در واکنش­های PCR استفاده شد. در تکثیر نواحی فاصله­ساز داخلی بین ژن­های ریبوزومی با استفاده از آغازگر­های ITS۱ و ITS۴ یک قطعه DNA به اندازه ۷۰۰ جفت باز ردیابی شد. قطعه مذکور با آنزیم­های برشیTaq I  Xba I, Hae III, Bam HI, Hind III, Sac I, Pst I, Nde I, Xho I, Hinc II, Hinf I, Eco RI, هضم شد. ولی آنزیم­های Xba I, Bam HI, Hind III, Sac I, Pst I, Nde I, Xho I فاقد محل برش بودند. نتایج حاصله نشان داد که جدایه­های Rhizoctonia solani AG۴ هتروژن بوده و ITS-RFLP با استفاده از آنزیم Hinc II تفاوت بین زیرگروه­های AG۴-HG I و AG۴-HG II رااز نظر الگوی برش آنزیمی نشان داد.

کلمات کلیدی:
genetic diversity, ITS-rDNA, PCR, Rhizoctonia solani AG۴

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/1907887/