CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

بررسی بیوانفورماتیکی امکان حضورmiRNA های جدید در ناحیه افزایش یافته3q26.33 در سرطان ریه

عنوان مقاله: بررسی بیوانفورماتیکی امکان حضورmiRNA های جدید در ناحیه افزایش یافته3q26.33 در سرطان ریه
شناسه ملی مقاله: CIGS13_0893
منتشر شده در اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ژنتیک ایران در سال 1393
مشخصات نویسندگان مقاله:

امیر باقری - گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
سیده فاطمه رضوی پور - بخش سلولی و مولکولی، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران
مهشید ملکوتیان - گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
سیدجواد مولی - گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

خلاصه مقاله:
سرطان ریه بیشترین میزان مرگ و میر ناشی از سرطان در جهان را به خود اختصاص داده است. دو فرم اصلی سرطان ریهNon-smallSmall-cell lung cancer و cell lung cancerتغییرات کروموزومی متعددی را نشان می دهند، که مهمترین آنها تکثیر در منطقهی3q26.3می باشد. از سوی دیگر نشان داده شده که(miRNA) microRNAها به عنوان تنظیم کننده های جدید دارای نقش های انکوژنی و تومورساپرسوری در فرآیند تومورزایی هستند. امروزه آنالیزهای بیوانفورماتیکی از مهمترین روش های کشفmiRNAهای جدید در نواحی افزایش و حذف کروموزومی محسوب میگردد. در این مطالعه نواحی اینترونی حفاظت شده ژنSox2-otواقع در ناحیه 3q26.3به منظور شناساییmiRNAهای جدید مورد بررسی های بیوانفورماتیکی قرار گرفت. در این راستا ابتدا به بررسی ساختارهای ساقه -حلقه موجود در ناحیه ی افزایش یافته 3q26.33 به کمک نرم افزارSSCprofilerپرداخته، سپس تواالی های شناسایی شده را بابرنامه هایMicroprocessor SVM و CID-miRNA ،MiPredمورد آنالیز قرار دادیم. نتایج بدست آمده حاکی از وجود 30 توالی بالقوه برای miRNAهای جدید بود که در نهایت 3 مورد از ساختارهای ساقه -حلقه ای که در مجموع بهترین ویژگی های مورد انتظاربرای یکmiRNAرا داشتند انتخاب و کلون نمودیم تا به بررسی نقش آنها در سرطان زایی ریه بپردازیم

کلمات کلیدی:
سرطان ریه ، Sox2ot ، بیوانفورماتیک ، microRNA

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/328557/