بررسی فیلوژنی شترهای تک کوهانه و دو کوهانه ایران براساس توالی ژن ۱۶S rRNA

شتر گونه ­ای بسیار مقاوم در برابر خشکی است که در سخت­ ترین شرایط آب و هوایی، محصولاتی مانند شیر و گوشت تولید می ­کند. با توجه به این ­که تعداد شترهای ایران در حال کاهش است، برای حفظ و بهبود تولیدات این گونه، مطالعات کاربردی ژنتیکی ضروری است. هدف از انجام این مطالعه، بررسی بیوانفورماتیکی و فیلوژنتیکی توالی نوکلئوتیدی ژن ۱۶SrRNA میتوکندریشترهای تک­ کوهانه و دوکوهانه ایرانی بود. در پژوهش حاضر از ۱۰ نمونه شتر دوکوهانه و ۱۰ نمونه شتر تک­ کوهانه مناطق مختلف، نمونه خون جمع آوری شد. پس از استخراج DNA، ژن ۱۶SrRNA میتوکندریایی به طول ۱۵۱۲جفت باز با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر شد. هم ­ردیفی کامل نوکلئوتیدی شترهای تک­ کوهانه و دوکوهانه ایرانی با روش اتوماتیک سانگر صورت گرفت و سپس توالی­ های به ­دست آمده با توالی­ های حاصل از مطالعات دیگر مقایسه شد. نتایج به ­دست آمده نشان داد شباهت نوکلئوتیدی ژن ۱۶SrRNA میتوکندریایی با هم ­ردیفی کامل سایر شترسانان موجود در بانک جهانی ژن ۹۳/۹۸ تا ۱۰۰ درصد محاسبه گردید. مقایسه هم ­ردیفی نوکلئوتیدی، رسم ماتریس فواصل ژنتیکی و رسم درخت فیلوژنتیکی هم ­ردیفی کامل حاصله از آنالیز فاصله ژنتیکی نشان داد که شترهای تک­ کوهانه ایران بیش ­ترین شباهت با شتر تک ­کوهانه عربی و شترهای دوکوهانه ایران بیش ­ترین شباهت با شتر دوکوهانه باختری دارد. هم­ چنین ترسیم این درخت نشان داد که جمعیت شترهای ایرانی یک گروه مونوفیلتیک هستند.

کلیدواژه ها:

DNAمیتوکندری ، تنوع ژنتیکی ، ژن ۱۶s rRNA ، شتر