شناسایی و بررسی بیان ژن های HvPIP۱;۴ و HvnsLTP دخیل در تحمل به تنش خشکی در جو
محل انتشار: مجله فرآیند و کارکرد گیاهی، دوره: 8، شماره: 30
سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 205
فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JISPP-8-30_023
تاریخ نمایه سازی: 13 دی 1400
چکیده مقاله:
مطالعه سازوکارهای تحمل تنش در گیاه جو، میتواند به درک بهتر اساس ژنتیکی تحمل به تنش خشکی کمک کند و در نهایت به بهبود خصوصیات ژنتیکی مرتبط با تحمل به تنش خشکی از طریق روشهای نوین ژنتیک مولکولی منجر شود. به منظور شناسایی و بررسی بیان ژنهای درگیر در تحمل به تنش خشکی گیاه جو، تجزیه و تحلیل ESTهای برگ و ریشه در ژنوتیپ های اسپانتانئوم (جو وحشی) و رقم زراعی نیمروز (متحمل در برابر تنش خشکی) صورت گرفت. اطلاعات اولیه کتابخانهها از پایگاههای جهانی دریافت گردید، سپس پیش پردازش دادهها و شناسایی ژنهای مرتبط با بیان متفاوت در بین کتابخانه ها، به کمک نرم افزارهای بیوانفورماتیک متعددی صورت گرفت. به منظور بررسی بیان ژنهای کاندید با استفاده از روش Real time-PCR، یک آزمایش به صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملا تصادفی با سه تکرار روی ژنوتیپها به عنوان عامل اول و تیمار آبیاری (شاهد و آبیاری در۵۰ درصد FC) به عنوان عامل دوم در گلدان صورت گرفت. همچنین عامل زمان نمونه برداری نیز در سه سطح صفر، ۲۴ و ۷۲ ساعت پس از اعمال تنش خشکی لحاظ شد. بر اساس میزان بیان ژن در شرایط تنش، دو ژن به نام های HvPIP۱;۴ (Plasma Membrane Intrinsic Protein ۱;۴) و HvnsLTP (Non-Specific Lipid Transport; nsLTP) به عنوان ژنهای مهم درگیر در پاسخ به تنش خشکی در جو شناسایی شدند. بر اساس نتایج حاصل از بررسی بیان این ژنها مشخص گردید که ژنوتیپ نیمروز به عنوان رقم متحمل از بیان بالاتری برای ژنهای کاندید برخوردار بود، به طوری که ژنهای PIP۱;۴ و nsLTP به ترتیب یک افزایش ۹۸/۹۵ و ۵۴/۵۳ برابری بعد از ۷۲ ساعت نسبت به شرایط شاهد از خود نشان دادند. بهعلاوه، نتایج این مطالعه نشان داد که تغییرات میزان بیان ژن PIP۱;۴ در مقایسه با ژن HvnsLTPجو در ژنوتیپ متحمل نیمروز بطور معنیداری (P<۰.۰۵) بیشتر از ژنوتیپ اسپانتانئوم بود. از آنجایی که این ژن حرکت آب و مواد محلول غیر باردار و دارای جرم مولکولی پایین را از شامههای پلاسمایی و تونوپلاست تسهیل میکند، این ژن احتمالا در روند تحمل به تنش خشکی نقش داشته باشد.
کلیدواژه ها:
Aquaporin ، Bioinformatics Analysis ، Gene Network ، Plasma membrane ، آکواپورین ، تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی ، شبکه ژنی ، غشاء پلاسمایی
نویسندگان
سجاد زارع
Lorestan University
فرهاد نظریان فیروزآبادی
Lorestan University
احمد اسماعیلی
Lorestan University
حسن پاک نیت
Shiraz University
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :