بررسی خاصیت ضد میکروبی تیموکینون در مهار آنزیم DNAجیراز به روش In silico

مقدمه: تیموکینون، مهم ترین ماده موثره ی موجود در سیاه دانه میباشد و یک ترکیب اساسی گیاهی و دارای فعالیت آنتی اکسیدانی است. آنزیمDNA جیراز آنزیمی از دسته توپوایزومراز ها که در فرایند های داخل سلولی مانند همانند سازی رشتهDNA یا رونویسی رشته DNA نقش دارد این آنزیم بیشتر در کلروپلاست گیاهان یافت میشود. هدف از این مطالعه بررسی اثر مهار کنندگی ترکیب تیموکینون بر فعالیت آنزیم DNAجیراز به روش داکینگ میباشد.روش ها: در این مطالعه، برای بررسی نحوه اتصال ترکیب به جایگاه فعال آنزیم، ترسیم ساختار شیمیایی ترکیبات، بهینه سازی انرژی و مطالعات داکینگ به ترتیب از نرم افزار های ChemDraw، HyperChem، AutoDockToolsو DS Visualizer استفاده شد.یافته ها: نتیجه عملیات داکینگ اشغال جایگاه فعال آنزیم توسط ترکیب تیموکینون و تشکیل پیوند هیدروژنی بین ترکیب تیموکینون و آمینواسید کلیدی THR۱۶۵ در جایگاه فعال می باشد.نتیجه گیری: با توجه به اینکه ترکیب مورد مطالعه توانست در جایگاه فعال آنزیم قرار بگیرید بهتر است اثر این ترکیب را در شرایط in vitro مورد آنالیز قرار داد.

کلیدواژه ها:

آنتی باکتریال ، تیموکینون ، مهار کننده ، DNA جیراز ، داکینگ