بهبود دقت شناسایی یرو تئین های اساسی در شبکه های PPI

شناسایی پروتئین های اساسی در شبکه برهم کنش پروتئین -پروتئین نه تنها برای درک فرآیند حیات سلولی مهم است بلکهدر تشخیص بیماریها و طراحی داروها بسیار سودمند است. به دلیل گرانی و زمان بالا در روش های آزمایشگاهی از روش هایمحاسباتی برای شناسایی پروتئین های اساسی بر اساس ساختار شبکه برهمکنش پروتئین - پروتئین استفاده می شود.روش های محاسباتی در شبکه برهمکنش پروتئین -پروتئین دارای دقت پایینی در کشف پروتئین های اساسی هستند و برخی ازپرو تئین های اساسی را به اشتباه تشخیص می دهند. روش های محاسباتی که از اندازه های مرکزیت استفاده می کنند دارایمحدودبتهایی در مقادیر مرکزیت پایین و کارایی ضعیف در شبکه های PPI ناکامل هستند. این شبکه ها تعداد زبادی برهمکنشمثبت کاذب دارند.ما اندازه مشابهت معنایی بین جفت پروتئین ها را براساس آنتولوژی ژنی " در شبکه های برهمکنش پروتئین -پروتئین ورودیمحاسبه کردیم و در اندازه گیری اطمینان لبه های شبکه و به دست آوردن یک شبکه وزن دار استفاده کردیم. با گسترش سطحهمسایگی های بیشتر بطور مستقیم و غیرمستقیم باعث بهبود دقت اندازه مرکزیت محلی می شویم و با ترکیب بهترین نمایندهاندازه مرکزیت محلی و سراسری ساختاری با اندازه های ویژگی های زبستی پروتیئن های اساسی به وسیله روش رگرسیونلحستیک دقت شناسایی پروتئین های اساسی را افزایش دادیم.روش پیشنهادی با روش های محاسباتی کارامد. در معیارهای آماری مختلف. پیاده سازی و مورد ارزیابی قرار گرفته است. نتایجنشان می دهد که روش پیشنهادی. دقت شناسایی پروتئین های اساسی را در مجموعه های داده ای YMBD, YHQ و YMIPSبهبود داده است. ترکیب معیارهای مرکزیت محلی و سراسری شبکه برهمکنش پروتئین -پرونئین با ویژگیهای زیستی پروتئین-های اساسی. دقت بیشتری در شناسایی پروتئین اساسی را نتیجه می دهد.

کلیدواژه ها:

دقت شناسایی ، پروتئین های اساسی ، شبکه های وزنی PPI ، سطح های همسایگی ، اندازه های مرکزیت ، ویژگی های زیستی پرو تئین های اساسی