بررسی بیوانفورماتیکی تاثیر ترکیبات گیاهی موجود در گیاهان دارویی Ferulago angulat، Scrophularia striata و Laurus nobilis در مهار پروتئین های موثر در بروز مقاومت آنتی بیوتیکی در استافیلوکوکوس اورئوس: یک مطالعه توصیفی

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 161

فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_RUMS-18-2_007

تاریخ نمایه سازی: 25 دی 1401

چکیده مقاله:

چکیده زمینه و هدف: اخیرا عفونت­های ناشی از استافیلوکوکوس اورئوس (Staphylococcus aureus; S. aureus) و ایجاد جدایه های مقاوم به آنتی بیوتیک­ها افزایش یافته است. بنابراین مطالعات فراوانی به منظور معرفی ترکیبات جدید با فعالیت ضد S. aureus به­ویژه ترکیباتی با منشاء طبیعی جهت مقابله با گونه­های مقاوم به آنتی بیوتیک انجام گرفته است. هدف از این مطالعه تعیین غربال­گری بیوانفورماتیکی مهارکننده­های نوین پروتئین­های مرتبط با بروز مقاومت آنتی­بیوتیکی موجود در گیاهان دارویی بود. مواد و روش­ها: در این مطالعه­ توصیفی، ابتدا ساختار سه بعدی ترکیبات فیتوشیمیایی موجود در سه گیاه دارویی Ferulago angulat، Scrophularia striata و Laurus nobilis از پایگاه داده PubChem دریافت شد. سپس ساختار سه بعدی چهار پروتئین مرتبط با بروز مقاومت آنتی­بیوتیکی شامل β-lactamase، پروتئین متصل شونده به پنی سیلین a۲ (a۲PBP)، ونکومایسین A (VanA) و D-آلانیل D-آلانین دی پپتیداز (VanX) به کمک پایگاه داده­های پروتئین به دست آمد. در نهایت، توانایی ترکیبات شیمیایی انتخاب شده جهت مهار پروتئین­های مرتبط با مقاومت آنتی بیوتیکی مذکور با استفاده از روش داکینگ مولکولی به­وسیله نرم افزار ۱. ۲iGemdock  بررسی شد. یافته ها: نتایج نشان داد که اکثر ترکیبات مورد بررسی، برهمکنش­های مناسبی با تمامی پروتئین­های مورد مطالعه به ویژهVanX  دارند. نتایج هم­چنین نشان داد که دو ترکیب Phthalate (ethylhexyl-۲)Bis و Palmitic acid قوی­ترین برهمکنش­ها را با تمامی پروتئین­های مورد بررسی دارند.   نتیجه­گیری: نتایج این مطالعه نشان داد که که دو ترکیب Phthalate (ethylhexyl-۲)Bis  و Palmitic acid موجود در گیاهان دارویی بررسی شده کاندیدهای مناسبی برای مطالعات برون تنی و درون تنی مرتبط با فعالیت ضد S .aureus  مقاوم به آنتی­بیوتیک می­باشند. واژه­های کلیدی: استافیلوکوکوس اورئوس، مقاومت آنتی بیوتیکی، گیاهان دارویی، بیوانفورماتیک

نویسندگان

زینب شاکران

department of biology, faculty of science, University of Isfahan

زهرا شاکران

Department of Biotechnology, Faculty of advanced science and technologies, University of Isfahan

مختار نصرتی

Department of Biotechnology, Faculty of advanced science and technologies, University of Isfahan

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Blot S, Vandewoude K, Colardyn F. Staphylococcus aureus infections. N ...
  • De Kraker M, Jarlier V, Monen J, Heuer O, Van ...
  • Rahimipour F, Roudbari F, Azimian A, Youssefi M, Ghazvini K. ...
  • McGuinness WA, Malachowa N, DeLeo FR. Focus: Infectious Diseases: Vancomycin ...
  • Pantosti A, Sanchini A, Monaco M. Mechanisms of antibiotic resistance ...
  • Dedania VS, Hale BP, Bhatnagar P. Endogenous endophthalmitis due to ...
  • Aqil F, Khan MS, Owais M, Ahmad I. Effect of ...
  • Lim D, Strynadka NC. Structural basis for the β lactam ...
  • Courvalin P. Vancomycin resistance in gram-positive cocci. Clin Infect Dis ...
  • Otsuka N, Liu MH, Shiota S, Ogawa W, Kuroda T, ...
  • Mohtar M, Johari SA, Li AR, Isa MM, Mustafa S, ...
  • Blundell TL, Sibanda BL, Montalvão RW, Brewerton S, Chelliah V, ...
  • Nosrati M, Behbahani M. Molecular Docking Study of HIV-۱ Protease ...
  • Merghni A, Marzouki H, Hentati H, Aouni M, Mastouri M. ...
  • Nosrati M., Shakeran Z, Shakeran Z. Frangulosid as a novel ...
  • Nascimento GG, Locatelli J, Freitas PC, Silva GL. Antibacterial activity ...
  • Purrello S, Garau J, Giamarellos E, Mazzei T, Pea F, ...
  • Nosrati M, Behbahani M. Antibacterial Activity of Methanol Extracts from ...
  • Djeussi DE, Noumedem JA, Seukep JA, Fankam AG, Voukeng IK, ...
  • Zamaninan-Azodi M, Ardeshirylajimi A, Ahmadi N, Rezaee MB, Jalilian FA, ...
  • Jafari AA, Shohrati M, Mahmoudi R, Hoseini RH, Nosratpour S, ...
  • El-Sawi S, Ibrahim M, Ali A. In Vitro Cytotoxic, Antioxidant ...
  • Nosrati M, Behbahani M. In vitro and in silico antibacterial ...
  • Nosrati M, Behbahani M. In Vitro and in Silico Evaluation ...
  • Nosrati M, Shakeran Z, Shakeran Z. In Silico Screening Hepatitis ...
  • Lim D, Strynadka NC. Structural basis for the β lactam ...
  • Pieper U, Hayakawa K, Li Z, Herzberg O. Circularly permuted ...
  • Herzberg O, Moult J. Bacterial resistance to beta-lactam antibiotics: crystal ...
  • Roper DI, Huyton T, Vagin A, Dodson G. The molecular ...
  • Bussiere DE, Pratt SD, Katz L, Severin JM, Holzman T, ...
  • Blot S, Vandewoude K, Colardyn F. Staphylococcus aureus infections. N ...
  • De Kraker M, Jarlier V, Monen J, Heuer O, Van ...
  • Rahimipour F, Roudbari F, Azimian A, Youssefi M, Ghazvini K. ...
  • McGuinness WA, Malachowa N, DeLeo FR. Focus: Infectious Diseases: Vancomycin ...
  • Pantosti A, Sanchini A, Monaco M. Mechanisms of antibiotic resistance ...
  • Dedania VS, Hale BP, Bhatnagar P. Endogenous endophthalmitis due to ...
  • Aqil F, Khan MS, Owais M, Ahmad I. Effect of ...
  • Lim D, Strynadka NC. Structural basis for the β lactam ...
  • Courvalin P. Vancomycin resistance in gram-positive cocci. Clin Infect Dis ...
  • Otsuka N, Liu MH, Shiota S, Ogawa W, Kuroda T, ...
  • Mohtar M, Johari SA, Li AR, Isa MM, Mustafa S, ...
  • Blundell TL, Sibanda BL, Montalvão RW, Brewerton S, Chelliah V, ...
  • Nosrati M, Behbahani M. Molecular Docking Study of HIV-۱ Protease ...
  • Merghni A, Marzouki H, Hentati H, Aouni M, Mastouri M. ...
  • Nosrati M., Shakeran Z, Shakeran Z. Frangulosid as a novel ...
  • Nascimento GG, Locatelli J, Freitas PC, Silva GL. Antibacterial activity ...
  • Purrello S, Garau J, Giamarellos E, Mazzei T, Pea F, ...
  • Nosrati M, Behbahani M. Antibacterial Activity of Methanol Extracts from ...
  • Djeussi DE, Noumedem JA, Seukep JA, Fankam AG, Voukeng IK, ...
  • Zamaninan-Azodi M, Ardeshirylajimi A, Ahmadi N, Rezaee MB, Jalilian FA, ...
  • Jafari AA, Shohrati M, Mahmoudi R, Hoseini RH, Nosratpour S, ...
  • El-Sawi S, Ibrahim M, Ali A. In Vitro Cytotoxic, Antioxidant ...
  • Nosrati M, Behbahani M. In vitro and in silico antibacterial ...
  • Nosrati M, Behbahani M. In Vitro and in Silico Evaluation ...
  • Nosrati M, Shakeran Z, Shakeran Z. In Silico Screening Hepatitis ...
  • Lim D, Strynadka NC. Structural basis for the β lactam ...
  • Pieper U, Hayakawa K, Li Z, Herzberg O. Circularly permuted ...
  • Herzberg O, Moult J. Bacterial resistance to beta-lactam antibiotics: crystal ...
  • Roper DI, Huyton T, Vagin A, Dodson G. The molecular ...
  • Bussiere DE, Pratt SD, Katz L, Severin JM, Holzman T, ...
  • نمایش کامل مراجع