ردیابی و شناسایی Candidatus phytoplasma trifolii از درختان سیب در ایران
سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 134
فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_ARPP-10-3_004
تاریخ نمایه سازی: 4 بهمن 1401
چکیده مقاله:
چکیده در بازدیدهای بهار و تابستان سال ۱۳۹۷ از باغات درختان سیب در استان خراسان رضوی، علائم مشکوک به بیماری فیتوپلاسمایی مانند زردی، ریزبرگی، و همچنین برگ هایی که گوشوارک در آن به طور غیرعادی کشیده شده بود در سطح باغات مشاهده شد و ۳۳ نمونه از برگ درختان جمع آوری گردید. با استفاده از آغازگرهای عمومی P۱ / P۷ و آغازگرهای آشیان های R۱۶F۲n / R۱۶R۲، fU۵ / rU۳ و R۱۶MF۲ / R۱۶MR۲ در واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) از کلیه نمونههای دارای علائم، قطعات ۱۸۰۰ جفت باز در PCR عمومی و در PCRهای آشیان های به ترتیب قطعات ۱۲۵۰، ۸۷۶ و ۱۴۰۰ جفت باز تکثیر شدند. در نتایج حاصله مشخص گردید ۱۸ نمونه آلوده به فیتوپلاسما مثبت بودند. محصول PCR دومرحلهای با جفت آغازگرهای R۱۶F۲n / R۱۶R۲، همسانهسازی و تعیین ترادف شده و در بانک جهانی ژن ثبت گردید. مقایسه توالی های به دست آمده با توالی های موجود در NCBI توسط نرم افزار BLAST و همچنین بررسی چند شکلی طولی قطعات برشی (RFLP) حقیقی با محصول PCR دومرحله ای با استفاده از آنزیم های AluI، RsaIو Tru۱I (MseI)، نشان داد که فیتوپلاسمای همراه درختان سیب بیشترین شباهت را با Candidatus Phytoplasma trifolii مربوط به گروه افژولش شبدر (Clover proliferation group, ۱۶SrVI) دارند. آنالیز توالی ها با استفاده از نرم افزار iPhyClassifier، تعیین میزان تشابه نوکلئوتیدی و آنالیز تبارزایی با استفاده از ترادف کامل ژن RNA ریبوزومی ۱۶S نیز تعلق فیتوپلاسمای همراه درختان سیب در استان خراسان رضوی را در گروه ۱۶SrVI-A تایید کرد. این اولین گزارش از سیب های آلوده به Ca. Phytoplasma trifolii در ایران و سایر نقاط جهان است.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
رضا برازنده آق کاریز
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل
ناصر رادمان
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل
محمودرضا کریمی شهری
۲بخش تحقیقات گیاه پزشکی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان خراسان رضوی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، مشهد، ایران.
مهدی پیرنیا
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل.
عبدالحسین طاهری
گروه گیاهپزشکی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان.
سیدمهدی فاطمی
کارشناس بخش مدیریت آب و خاک، سازمان جهاد کشاورزی استان خراسان رضوی- مشهد
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :