شناسایی اختصاصی نماتد ریشه ‎گرهی Meloidogyne incognita رایج در باغات کیوی فروت استان های گیلان و مازندران با استفاده از توالی ژن sec-۱

سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 166

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ARPP-11-4_005

تاریخ نمایه سازی: 15 اسفند 1401

چکیده مقاله:

در سال­های اخیر، شیوع بیش از پیش نماتدهای ریشه‎ گرهی باعث ایجاد خسارت جدی در مناطق کشت کیوی فروت در شمال ایران شده است. با توجه به رواج چند گونه از این جنس در کشور، شناسایی دقیق گونه­های این نماتد در صنعت تولید محصول حائز اهمیت است. در این تحقیق، تلاش شد شناسایی مولکولی نماتد ریشه‎ گرهی به کمک واکنش زنجیره ای پلی­مراز، با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژن کدکننده یکی از پروتئین­های غدد مری (pharyngeal gland secretory protein, sec-۱) در جهت تایید شناسایی­های مبتنی بر ویژگی های ریخت­­ شناختی صورت گیرد. بدین منظور، پس از انجام نمونه برداری و جداسازی نماتدها از باغ های کیوی فروت آلوده در استان های گیلان و مازندران، اقدام به شناسایی اولیه با استفاده از خصوصیات ریخت ­شناختی گردید. جفت آغازگرهای Inc-K۱۴ برای تکثیر ناحیه SCAR و جفت آغازگرهای SEC-۱ برای تکثیر ژن sec-۱ به منظور تشخیص اختصاصی گونه Meloidogyne incognita از سایر گونه ها مورد استفاده قرار گرفتند. در همه نمونه های مورد بررسی، قطعه ای ۳۹۹ جفت بازی توسط جفت آغازگرهای Inc-K۱۴ و قطعه ای ۵۰۲ جفت بازی توسط جفت آغازگرهای SEC-۱ تکثیر گردید که قطعات مورد انتظار برای شناسایی گونه M. incognita می باشند. انجام آزمون PCR با استفاده از آغازگرهای Rjav/Fjav، Rar/Far و Rh/Fh که به ترتیب آغازگرهای اختصاصی گونه­های M. javanica، M. arenaria و M. hapla هستند، در این مطالعه منجر به تکثیر باند نشد. با توجه به نتایج به دست آمده، آغازگر SEC-۱ جهت شناسایی سریع و دقیق M. incognita در باغ های آلوده کیوی فروت (در این مطالعه) مناسب بوده و مشکلات تکثیر غیراختصاصی با آغازگرهای Inc-K۱۴ که ناحیه SCAR را تکثیر می­ کنند، نخواهد داشت.

نویسندگان

سیده نجمه بنی هاشمیان

گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران.

سالار جمالی

گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران.

مرتضی گل محمدی

موسسه تحقیقات علوم باغبانی، پژوهشکده مرکبات و میوه های نیمه گرمسیری، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رامسر، ایران.

محمود قاسم نژاد

گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abad P, Favery B, Rosso MN, Castagnone-Sereno P, ۲۰۰۳. Root-knot ...
  • Akyazi F, Felek A, ۲۰۱۳. Molecular identification of root-knot nematode ...
  • Adam MAM, Phillips MS, Blok VC, ۲۰۰۷. Molecular diagnostic key ...
  • Alvarez-Ortega S, Brito JA, Subbotin S, ۲۰۱۹. Multigene phylogeny of ...
  • Arzanlou M, Ghasemi Esfahlan S, Khodaei S, Tavakoli M, Babaei ...
  • Barros AF, Campos VP, Souza LN, Costa SS, Terra WC, ...
  • Blok VC, Powers TO, ۲۰۰۹. Biochemical and molecular identification. In: ...
  • Calderon-Urrea A, Vanholme B, Vangestel S, Kane SM, Bahaji A, ...
  • Chen P, Peng DL, Zheng JW, ۱۹۹۰. Description of a ...
  • Chitwood BG, ۱۹۴۹. Root-knot nematodes, part I. A revision of ...
  • Da Silva AT, Penna JCV, Goulart LR, Santos MA, Arantes ...
  • Devran Z, Sogut MA, ۲۰۰۹. Distribution and identification of root-knot ...
  • Dong K, Dean RA, Fortnum BA, Lewis SA, ۲۰۰۱. Development ...
  • Eisenback JD, Triantaphyllou HH, ۱۹۹۱. Root-knot nematodes: Meloidogyne species and ...
  • Eskandarzadeh N, Moslehi Sh, Vaez N, ۲۰۲۰. Evaluation of the ...
  • FAO, FAOSTAT, Production, ۲۰۲۰. http://www.Fao.orgFourie H, Zijlstra C, Mcdonald A, ...
  • Gasser RB, ۲۰۰۱. Identification of parasitic nematodes and study of ...
  • Ghasemi Esfahlan S, Arzanlou M, Babayahri A, Torbati M, Narmani ...
  • Golmohammadi M, Ghasemi M, Banihashemian SN, ۲۰۱۹. The study of ...
  • Hajihassani A, Lawrence KS, Jagdale GB, ۲۰۱۸. Plant parasitic nematodes ...
  • Hartman K, Sasser JN, ۱۹۸۵. Identification of Meloidogyne species on ...
  • Hasan ST, Abood ID, Abd Al Rasoul AM, ۲۰۲۰. Diagnostic ...
  • Hussey RS, Janssen GJW, ۲۰۰۲. Root-knot nematodes: Meloidogyne species. In: ...
  • Hwang SM, Jang KS, Choi YH Choi GJ, ۲۰۱۶. Development ...
  • Janssen T, Karssen G, Verhaeven M, Coyne D, Bert W, ...
  • Jones JT, Haegeman A, Danchin EGJ, Gaur HS, Helder J, ...
  • Hewezi T, Baum TJ, ۲۰۱۳. Manipulation of plant cells by ...
  • Karssen G, ۲۰۰۲. The plant-parasitic nematode genus Meloidogyne goldi, ۱۸۹۲ ...
  • Kofoid CA, White WA, ۱۹۱۹. A new nematode infection of ...
  • Neal JC, ۱۸۸۹. The root-knot disease of the peach, orange ...
  • Niu JH, Guo QX, Jian H, Chen CL, Yang D, ...
  • Quentin M, Abad P, Favery B, ۲۰۱۳. Plant parasitic nematode ...
  • Randig O, Bongiovanni M, Carneiro RM Castagnone-Sereno P, ۲۰۰۲. Genetic ...
  • Ray C, Abbott, AG, Hussey, RS, ۱۹۹۴. Trans-splicing of a ...
  • Salgado SML, Guimarães NMRB, Botelho CE, Tassone GAT, Marcelo AL, ...
  • Sellers GS, Jeffares DC, Lawson B, Prior T, Lunt DH, ...
  • Sikora R, Coyne D, Hallmann J, Timper P, ۲۰۱۸. Plant ...
  • Subbotin SA, Rius JEP, Castillo P, ۲۰۲۱. Systematics of root-knot ...
  • Tao Y, Xu C, Yuan C, Wang H, Lin B, ...
  • Tesarova B, Zouhar M, Rysanek P, ۲۰۰۳. Development of PCR ...
  • Thoden TC, Korthals GW, Termorshuizen AJ, ۲۰۱۱. Organic amendments and ...
  • Taylor DP, Netscher C, ۱۹۷۴. An improved technique for preparing ...
  • Treub M, ۱۸۸۵. Onderzoekingen over sereh-ziek suikkeriet gedaan in s’Lands ...
  • Yang Y, Hu X, Liu P, Chen L, Peng H, ...
  • Zijlstra C, Donkers-Venne DTHM, Fargette M, ۲۰۰۰. Identification of Meloidogyne ...
  • Zeng J, Zhang Z, Li M, Wu X, Zeng Y, ...
  • نمایش کامل مراجع