ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

بررسی تنوع و روابط ژنتیکی در برخی از توده های بنگ دانه (Hyoscyamus spp.) بر اساس چندشکلی حاصل از درج رتروترانسپوزونی

محل انتشار: مجله پژوهش های ژنتیک گیاهی، دوره: 9، شماره: 1
سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 134

فایل این مقاله در 18 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1635313

شناسه ملی سند علمی:

JR_PGRLU-9-1_009

تاریخ نمایه سازی: 29 فروردین 1402

چکیده مقاله:

بنگ­دانه به­ واسطه آلکالوئیدهای هیوسیامین و اسکوپولامین از ارزش دارویی بالایی برخوردار است. بهبود کیفیت و کمیت آلکالوئیدهای بنگ­دانه با استفاده از روش ­های بهنژادی پیشرفته، مستلزم ارزیابی تنوع این گیاه است. تنوع ژنتیکی این گیاه با استفاده از نشانگرهای مورفولوژیکی، بیوشیمیایی و مولکولی در مطالعات متعددی بررسی شده و برتری نشانگرهای مولکولی نسبت به سایر نشانگرها به اثبات رسیده است. به همین منظور، در سال ۱۳۹۸ تنوع ژنتیکی ۹۶ ژنوتیپ بنگ­دانه جمع ­آوری شده از رویشگاه­ های شمال غرب کشور، با استفاده از نشانگرهای مولکولی IRAP وREMAP مورد بررسی قرار گرفت. برای نشانگرهای IRAP از ۳۶ ترکیب ممکن حاصل از هشت آغازگرLTR ، هفت ترکیب تکثیر مناسب و قابل امتیازدهی داشتند. در نشانگر REMAP از ترکیب ۱۱ آغازگر ISSR با هشت آغازگر  LTR استفاده شد که از ۸۸ ترکیب ممکن، ۱۲ ترکیب قابل امتیازدهی بودند. متوسط میزان اطلاعات چندشکلی برای نشانگرهای IRAP و REMAP به ­ترتیب ۰.۳۰ و ۰.۳۲ و میانگین شاخص نشانگر برای این دو نشانگر برابر ۲.۵۹ و ۲.۴۷ برآورد شد. بر اساس این معیارها، نشانگر REMAP در برآورد تنوع ژنتیکی بنگ دانه کاراتر از IRAP بود. در تجزیه واریانس مولکولی با استفاده از این نشانگر­ها، تنوع درون ­جمعیتی بیشتر از بین ­جمعیتی برآورد شد که نشان از تنوع بالای این توده ­ها­ در شمال­ غرب ایران می­ دهد. تجزیه خوشه ای بر اساس نشانگر IRAP نتوانست گونه ها و توده­ ها­ را از یکدیگر تفکیک نماید ولی بر اساس نشانگر REMAP، گونه های H.pusillus و H.reticulatus تا حد بالایی از هم تفکیک شدند. حصول شاخص شانون بالا در این پژوهش، نشان داد که نشانگرهای رتروترانسپوزونی IRAP و REMAP با درج بالای خود در ژنوم توده ­ها­ی بنگ­ دانه، تنوع ژنتیکی بالایی را در درون توده ­ها­ی بنگ­دانه القاء نموده­ اند.

کلیدواژه ها:

Henbane ، Genetic diversity ، IRAP and REMAP markers ، بنگ دانه ، تنوع ژنتیکی ، نشانگرهای IRAP و REMAP

نویسندگان

علیرضا اصغری میرک

Department of Agriculture, Payame Noor University, Meshginshahr, Meshginshahr, Iran

سید سیامک علوی کیا

Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Tabriz University, Tabriz, Iran

سیدابوالقاسم محمدی

Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Tabriz University, Tabriz, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Afanasenko, O., Rozanova, I., Gofman, A., Lashina, N., Novakazi, F., ...
  • Baloch, F.S., Guizado, S.J.V., Altaf, M.T., Yuce, I., Çilesiz, Y., ...
  • Chen, H., Guo, A., Wang, J., Gao, J., Zhang, S., ...
  • Excoffier, L., Smous, P.E. and Quattro, J.M. (۱۹۹۲). Analysis of ...
  • Fazli, P. and HaghMyrza, K. (۲۰۱۱). Study of genetic diversity ...
  • Gorji, A.M., Poczai, P., Polgar, Z. and Taller, J. (۲۰۱۱). ...
  • Hassani Tsieh, S.F., Samizadeh Lahiji, H., Shoaei Deilami, M. (۲۰۱۴). ...
  • Hosseini, S., Rahgozar, M.R. and Badakhshan, H. (۲۰۲۱). Investigating the ...
  • Huff, D.R., Peakal, R. and Smouse, P.E. (۱۹۹۳). RAPD variation ...
  • Kalendar, R. and Schulman, A. (۲۰۰۶). IRAP and REMAP for ...
  • Kharestani, H., Nejad Ghomi, N.A.A. and Mehrabi, A.A. (۲۰۱۳). Investigation ...
  • Khosru Mehr, F., Jafari, A. and Hamdi, M. (۲۰۱۲). A ...
  • Lightbourn, G.J., Jelesko, J.G. and Veilleux, R.E. (۲۰۰۷). Retrotransposon-based markers ...
  • Mahfouze, S.A. and Ottai, M. (۲۰۱۱). Assessment of genetic variability ...
  • Manetti, M.E., Rossi, M., Costa, A.P., Clausen, A.M. and Van ...
  • Mirzadeh Waqfi, S. (۲۰۱۳). Comparison of seed morphology of several ...
  • Moghaddam, M., Ehdaie, B. and Waines, G. (۲۰۰۰). Genetic diversity ...
  • Mohsenzadeh Golfzaei, M., Samizadeh Lahiji, H., Alami, A., Shoaei Deilami, ...
  • Kaab Omeer, A., Pourmohammadi, P., Gilani, A., Alami, S.K., Farkhari, ...
  • Kouhsari, S.M., Sharifi, G., Ebrahimzadeh, H. and Khatamsaz, M. (۲۰۰۶). ...
  • Nejad Habib Vash, F., Rahman, F., Heidari, R. and Jamei, ...
  • Niu, Y.X. and Zhao, F.K. (۲۰۱۰). Clustering Analysis and identification ...
  • Peakall, R.O.D. and Smouse, P.E. (۲۰۰۶). GenAlex ۶: genetic analysis ...
  • Powell, W., Morgante, M., Andre, C., Hanafey, M., Vogel, J., ...
  • Prasad, P., Srivastava, A., Singh, V., Kushwaha, H. K., Kishor, ...
  • Rogers, S.A. and Pauls, K.P. (۲۰۰۰). Ty۱-copia-like retrotransposons of tomato ...
  • Saghai-Maroof, M.A., Soliman, K., Jorgensen, R.A. and Allard, R.W. (۱۹۸۴). ...
  • Shajdehahmadi, M. and Kharazi, M. (۲۰۱۵). The use of ISSR ...
  • Sokhdari, A., Malekzadeh Shafaroodi, S., Asghari, A. and Kiani Freeze, ...
  • Tamura, K., Dudley, J., Nei, M. and Kumar, S. (۲۰۰۷). ...
  • Yadav, R., Lal, R.K. and Gupta, M.M. (۲۰۱۸). Prediction of ...
  • Yousefi, M.J. (۲۰۰۹). Evaluation of genetic diversity of some Iranian ...
  • Zanganeh, F. and Sheidai, M. (۲۰۲۲). Population genetic diversity and ...
  • Zhu, J., Gale, M.D., Quarrie, S., Jackson, M.T. and Bryan, ...
  • Afanasenko, O., Rozanova, I., Gofman, A., Lashina, N., Novakazi, F., ...
  • Baloch, F.S., Guizado, S.J.V., Altaf, M.T., Yuce, I., Çilesiz, Y., ...
  • Chen, H., Guo, A., Wang, J., Gao, J., Zhang, S., ...
  • Excoffier, L., Smous, P.E. and Quattro, J.M. (۱۹۹۲). Analysis of ...
  • Fazli, P. and HaghMyrza, K. (۲۰۱۱). Study of genetic diversity ...
  • Gorji, A.M., Poczai, P., Polgar, Z. and Taller, J. (۲۰۱۱). ...
  • Hassani Tsieh, S.F., Samizadeh Lahiji, H., Shoaei Deilami, M. (۲۰۱۴). ...
  • Hosseini, S., Rahgozar, M.R. and Badakhshan, H. (۲۰۲۱). Investigating the ...
  • Huff, D.R., Peakal, R. and Smouse, P.E. (۱۹۹۳). RAPD variation ...
  • Kalendar, R. and Schulman, A. (۲۰۰۶). IRAP and REMAP for ...
  • Kharestani, H., Nejad Ghomi, N.A.A. and Mehrabi, A.A. (۲۰۱۳). Investigation ...
  • Khosru Mehr, F., Jafari, A. and Hamdi, M. (۲۰۱۲). A ...
  • Lightbourn, G.J., Jelesko, J.G. and Veilleux, R.E. (۲۰۰۷). Retrotransposon-based markers ...
  • Mahfouze, S.A. and Ottai, M. (۲۰۱۱). Assessment of genetic variability ...
  • Manetti, M.E., Rossi, M., Costa, A.P., Clausen, A.M. and Van ...
  • Mirzadeh Waqfi, S. (۲۰۱۳). Comparison of seed morphology of several ...
  • Moghaddam, M., Ehdaie, B. and Waines, G. (۲۰۰۰). Genetic diversity ...
  • Mohsenzadeh Golfzaei, M., Samizadeh Lahiji, H., Alami, A., Shoaei Deilami, ...
  • Kaab Omeer, A., Pourmohammadi, P., Gilani, A., Alami, S.K., Farkhari, ...
  • Kouhsari, S.M., Sharifi, G., Ebrahimzadeh, H. and Khatamsaz, M. (۲۰۰۶). ...
  • Nejad Habib Vash, F., Rahman, F., Heidari, R. and Jamei, ...
  • Niu, Y.X. and Zhao, F.K. (۲۰۱۰). Clustering Analysis and identification ...
  • Peakall, R.O.D. and Smouse, P.E. (۲۰۰۶). GenAlex ۶: genetic analysis ...
  • Powell, W., Morgante, M., Andre, C., Hanafey, M., Vogel, J., ...
  • Prasad, P., Srivastava, A., Singh, V., Kushwaha, H. K., Kishor, ...
  • Rogers, S.A. and Pauls, K.P. (۲۰۰۰). Ty۱-copia-like retrotransposons of tomato ...
  • Saghai-Maroof, M.A., Soliman, K., Jorgensen, R.A. and Allard, R.W. (۱۹۸۴). ...
  • Shajdehahmadi, M. and Kharazi, M. (۲۰۱۵). The use of ISSR ...
  • Sokhdari, A., Malekzadeh Shafaroodi, S., Asghari, A. and Kiani Freeze, ...
  • Tamura, K., Dudley, J., Nei, M. and Kumar, S. (۲۰۰۷). ...
  • Yadav, R., Lal, R.K. and Gupta, M.M. (۲۰۱۸). Prediction of ...
  • Yousefi, M.J. (۲۰۰۹). Evaluation of genetic diversity of some Iranian ...
  • Zanganeh, F. and Sheidai, M. (۲۰۲۲). Population genetic diversity and ...
  • Zhu, J., Gale, M.D., Quarrie, S., Jackson, M.T. and Bryan, ...
    • نمایش کامل مراجع