بررسی های مولکولی و بیوانفورماتیک جهت تایید ژنهای دخیل در مسیر بیوسنتز آنتوسیانین در زیره سبز

گیاهان دارویی ، به علت وجود ترکیبات مختلفی که در طول واکنش های متابولیکی ، در آنها انباشته می شود، دارای خواص دارویی و غذایی متعدد می باشند. زیره سبز گیاهی یک ساله و علفی ، متعلق به خانواده چتریان بوده و یکی از قدیمی ترین و اقتصادیترین گیاهان دارویی می باشد. ترکیبات آنتی اکسیدانی و فلاونوئیدها، از مهم ترین ترکیبات شیمیایی گیاهان خانواده چتریان می باشند. آنتوسیانین ها دسته بزرگی از فلاونوئیدها هستند که از اکسیداسیون چربی ها، پروتئین ها و اسیدهای نوکلئیک جلوگیری می کنند. آنتوسیانین ها متابولیت های ثانویه ای هستند که از انتقال یک مولکول قند به آنتوسیانیدین ایجاد می شوند. شدت و الگوی بیوسنتز آنتوسیانین و در حالت کلی ، کنترل بیان ژنهای ساختاری، تحت کنترل ژنهای تنظیم کننده قرار دارد. در مطالعه حاضر، حضور پنج ژن منتخب در مسیر بیوسنتز فلاونوئیدها در زیره سبز، که بر اساس تحقیقات پیشین به روش NGS بیشترین تغییر بیانی را داشتند؛ توسط PCR تکثیر و تایید شدند و دو ژن در مسیر بیوسنتز آنتوسیانین مورد بررسی بیوانفورماتیکی قرار گرفتند. مکان ژنی DN۱۱۹۶ یک گلیکوزیل ترانسفراز از خانواده GT۶ شناسایی شد که همراه با دو فاکتور رونویسی ، با انتقال یک مولکول قند به آنتوسیانیدین ، آن را به آنتوسیانین تبدیل و حلالیت آن را بیشتر می کند . جایگاه ژنی مورد بررسی DN۳۲۶۴۰ نیز یک فاکتور رونویسی از خانواده bHLH می باشد که از طریق برهمکنش با ده پروتئین دیگر از جمله چند فاکتور رونویسی از خانوادههای MYB و WD۴۰، تولید آنتوسیانین را تنظیم می کند. ساختار ثانویه و دامین این دو توالی بیشترین شباهت را با جایگاه هترولوگ آنها در هویج داشت .

کلیدواژه ها:

آنتوسیانین ، زیره سبز ، فاکتور رونویسی ، گلیکوزیل ترانسفراز