طراحی بیوانفورماتیک و ساخت ایمونوژن RBD علیه اتصال ویروس SARS CoV_۲
سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 118
فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_ADST-13-2_002
تاریخ نمایه سازی: 10 مرداد 1402
چکیده مقاله:
ویروس مسری SARS CoV_۲ به سرعت در جهان شیوع پیدا کرد. این ویروس بیش از ۵۵۰ میلیون نفر را در سراسر جهان آلوده کرده و منجر به مرگ حدود ۷ میلیون نفر شده است. در سازوکار تهاجم ویروس، زیرواحد متصل شونده به گیرنده (RBD) از پروتئین Spike نقش مهمی در ورود ویروس به سلول میزبان دارد. در این مطالعه، با توجه به رویکردهای بیوانفورماتیکی، طراحی کاست، سازگاری کدون و پایداری پروتئین و درنهایت صحت سازه طراحی شده با بررسی بیان پروتئینی سنجیده شد. برای افزایش احتمال بیان کاست RBD، کدون های ژنی و پارامترهای مختلف بهینه شده و تجزیه و تحلیل ترمودینامیکی ساختار mRNA برای افزایش ثبات انجام گردید. ساختار پروتئین سوم نیز پیش بینی شد و کیفیت ساختارها ارزیابی شدند. اپی توپ های خطی و فضایی تعیین شدند. پروتئین نوترکیب RBD بالاترین شاخص آنتی ژنی را نشان داد. شاخص سازگاری کدون پروتئین نوترکیب به ۹۶/۰ افزایش یافت. ساختار سوم پیش بینی شده بر اساس سرور I_TASSER کیفیت خوبی را نشان داد. تجزیه و تحلیل ترمودینامیکی ساختار mRNA نشان داد که ساختار پیش بینی شده پایدار است و اپی توپ های تطبیقی و خطی در هر سه حوزه پروتئین نوترکیب مشاهده شده است. سپس سازه مورد نظر در میزبان باکتریایی بیان شد. نتایج ایمونوانفورماتیکی و بیان نشان داد سازه نوترکیب طراحی شده آنتی ژنیسیته و پتانسیل تولید بالایی دارد و می می تواند به عنوان یک کاندید ایمونوژن علیه ویروس SARS CoV_۲ در مطالعات بعدی استفاده شود.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
امیر رضایی
دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه میکروبیولوژی، دانشگاه شاهد، تهران، ایران
شهرام نظریان
دانشیار، دانشکده علوم پایه، دانشگاه جامع امام حسین(ع)، تهران، ایران
سید میرلطیف موسوی گرگری
استاد گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شاهد، تهران، ایران
حسین سمیعی ابیانه
دانشجوی کارشناسی ارشد، مرکز زیست شناسی، دانشگاه جامع امام حسین، تهران، ایران
عماد کردبچه
کارشناس ارشد، دانشکده علوم پایه، دانشگاه جامع امام حسین(ع)، تهران، ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :