بررسی تفاوت توزیع آماری اثرات مارکرهای چندشکلی تک نوکلئوتیدی، بر اریبی ناشی از پیش انتخاب حیوانات، برای ژنوتیپ شدن در انتخاب ژنومیک

سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 102

نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_AEJO-14-4_025

تاریخ نمایه سازی: 17 مرداد 1402

چکیده مقاله:

The bias in the selection of superior animals and accurate prediction of hereditary values of animal offspring selected in future generations is one of the important topics of breeding; therefore, the study of oblique trends in successive generations can be effective in the method of unbiased selective animals in the future. The statistical distribution of the effects of single nucleotide markers can be different in different traits and occupy a range from the normal distribution to the gamma distribution; therefore, the study of the amount of bias caused by pre-selection for different traits can be different according to their genetic structure. The purpose of this study was to investigate the effect of statistical distribution of the effects of SNPs on the biased process of estimating breeding values resulting from pre-selection of animals by genomic selection method. The statistical distributions studied included two distributions of normal and gamma, the biased trend of each of which was studied during consecutive generations. The bias criterion includes the regression of actual correction values on the estimated correction values. Initial Simulation and historical population in the form of two selection scenarios in three different traits with different heritability in ۱۰ consecutive generations by two selection scenarios of ۱۰% and ۵۰% and the number of three QTL species were simulated accurately to estimate genomic breeding values using QMSim software. The need for calculations was analyzed using R software. The regression of TBVs on their GEBVs in the first generation whose genotyping was random was about one and unbiased; But by making choices based on superior breeding values from the second generation onwards it created a bias. As the number of consecutive selection generations increases so does the amount of bias but the rate of change in this bias decreased dramatically after the second generation and remained almost constant in the fourth generation which could be due to a reduction in genetic and phenotypic variance as a result of continuous selection known as the Bolmer effect. The results showed that in both statistical distributions, the amount and intensity of bias and its trend are almost the same and the difference in the statistical distribution of effects will not cause a difference in the amount and trend of bias. Moreover, due to the stabilization of the amount of bias in the ۴th generation onwards, it is possible to correct the amount of bias from the ۴th generation onwards by using a scale corrector.

کلیدواژه ها:

انتخاب ژنومیک ، اریبی ، توزیع گاما و نرمال ، ارزش های اصلاحی ژنومی

نویسندگان

جبار جمالی

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران

علیرضا احسانی

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

سید حسن حافظیان

گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران

محسن قلی زاده

گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Villumsen, T.M. and Janss, L., ۲۰۰۹. Baysian genomic selection: the ...
  • Meuwissen, T.H.E., Hayes, B.J. and Goddard M.E., ۲۰۰۱. Prediction of ...
  • Gowane, G.R., Lee, S.H., Clark, S., Moghaddar, N., AlMamun, H.A. ...
  • VanRaden, P., ۲۰۰۹. Invited review: Reliability of genomic predictions for ...
  • Rahbar, R., ۲۰۲۰. Effect of age at first calving (AFC) ...
  • Patry, C. and Ducrocq, V., ۲۰۱۱. Evidence of biases in ...
  • VanRaden, P.M., ۲۰۰۸. Efficient Methods to Compute Genomic Predictions. J. ...
  • Vitezica, Z., ۲۰۱۱. Bias in genomic predictions for populations under ...
  • Ehsani, A., Janss, L. and Christensen, O., ۲۰۱۱. Effects of ...
  • Sargolzaei, M. and Schenkel, F.S., ۲۰۰۹. QMSim: a large-scale genome ...
  • Henderson, C.R., ۱۹۷۵. Best Linear Unbiased Estimation and Prediction under ...
  • Reverter, A., ۱۹۹۴. Technical note: detection of bias in genetic ...
  • Falconer, D.S., ۱۹۹۶. Introduction to Quantitative Genetics. Prentice Hall, Harlow, ...
  • Zargarian, B., Amin Afshar, M., Saatchi, M. and Noushtari, A., ...
  • Zhao, Y., Gowda, M., Longin, F.H., Würschum, T., Ranc, N. ...
  • Bijma, P., ۲۰۱۲. Accuracies of estimated breeding values from ordinary ...
  • Cesarani, A., Pocrnic, I., Macciotta, N.P.P., Fragomeni, B.O., Misztal, I. ...
  • Bulmer, M.G., ۱۹۷۶. The effect of selection on genetic variability. ...
  • Van Grevenhof, E.M., Van Arendonk, J.A. and Bijma, P., ۲۰۱۲. ...
  • نمایش کامل مراجع