شناسایی نشانه های انتخاب مرتبط با آترزی دستگاه گوارش در گوساله های هلشتاین
محل انتشار: مجله تحقیقات تولیدات دامی، دوره: 12، شماره: 2
سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 59
فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_ARGU-12-2_005
تاریخ نمایه سازی: 26 آبان 1402
چکیده مقاله:
ضایعات انسدادی دستگاه گوارش از مهمترین مشکلات مادرزادی هستند که نتیجه آن، مرگ و میر گوسالهها در مدت کوتاهی بعد از تولد است. ژژنوم شایعترین مکان بعد از مری برای انسداد کامل یا آترزی است که فقدان مادرزادی یا انسداد کامل قسمتی از حفره روده است. شناخت زودرس آترزی برای پیشگیری از عوارض بعدی آن ضروری است. هدف پژوهش حاضر، شناسایی نشانههای انتخاب با استفاده از آماره نااریب تتا مرتبط با آترزی دستگاه گوارش در گوسالههای شیری هلشتاین است. به این منظور، مجموع ۴۶۶ حیوان برای ۷۷۷۹۶۲ جایگاه نشانگری چندشکلی تک نوکلئوتیدی (SNP) با استفاده از تراشههای Illumina ۷۷۷K BovineHD تعیین ژنوتیپ شدند. پس از کنترل کیفیت دادههای اولیه در نهایت، ۷۰۴۲۴۲ نشانگر SNP و ۴۶۶ راس دام (۳۷۵ راس شاهد و ۹۱ راس موردی) وارد تجزیههای بعدی شدند. با در نظر گرفتن صدک ۹/۹۹ کل ارزشهای تتا، هشت ناحیه ژنومی روی کروموزوم های ۷، ۱۲، ۱۳، ۲۱، ۲۲، ۲۳ (دو نقطه) و ۲۹ شناسایی شدند. بررسی ژنهای گزارش شده در این مناطق نشان داد که در داخل یا مجاورت این نواحی، ژنهای CSF۲، SIAH۳، TMEM۱۴A و SKIV۲L قرار داشتند، که با رشد و توسعه جنین، طول روده کوچک، مرگ سلولی و انواع سرطان مرتبط هستند. همچنین بررسی بیوانفورماتیکی این مناطق نشان داد ژنهای موجود در این مناطق با جایگاههای ژنی کنترلکننده صفات کمی مرتبط با حساسیت به بیماری و مسیرهای هستیشناسی مرتبط با تنظیم تفرق و تمایز سلولی، فعالیت پروتئینهای کینازی و فعالیت سوخت و ساز سلولی هستند. نتایج این تحقیق میتواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در زمینه شناسایی مناطق ژنومی و در نتیجه ژنهای مرتبط با آترزی در گاوهای هلشتاین فراهم آورد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
حسین محمدی
استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
محمد شمس اللهی
استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :