ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

مطالعه پویش کل ژنومی بر پایه آنالیز مسیر مرتبط با صفات تعداد کل بره متولد شده و سن اولین زایش در گوسفندان چند قلوزا

محل انتشار: فصلنامه پژوهشهای تولیدات دامی، دوره: 14، شماره: 41
سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 35

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1859741

شناسه ملی سند علمی:

JR_RAP-14-41_007

تاریخ نمایه سازی: 30 آذر 1402

چکیده مقاله:

چکیده مبسوط مقدمه و هدف: بررسی معماری ژنتیکی صفات تولیدمثلی به‎دلیل این‎که تاثیر عمده‎ای بر سیستم‎های تولیدی در صنعت گوسفنداری دارد، مورد توجه محققین قرار گرفته است. هدف پژوهش حاضر، شناسایی مناطق ژنومی موثر بر تعداد کل نتاج متولد شده و سن اولین بره‎زایی میش‎های نژاد پربازده کایاس با استفاده از آرایه­ های ژنومی ۵۰K بود. مواد و روش‎ها: در این تحقیق، از اطلاعات ژنوتیپی و فنوتیپی ۵۳۸ راس از میش ­های با باروری بالا شامل تعداد کل بره متولد شده در طول عمر و سن اولین زایش استفاده شد. آنالیز در سه مرحله شامل تعیین مکان SNPهای معنی­ دار با ژن، ارتباط ژن ­ها به طبقات عملکردی و مسیرهای بیوشیمیایی و در ادامه آنالیز همبستگی بین هر یک از مسیرهای عملکردی با صفات فنوتیپی مورد نظر انجام گرفت. ارزیابی پویش ژنومی برای صفات تولید مثلی در نرم ­افزار GEMMA انجام شد و سپس با استفاده از بسته نرم‎افزاری biomaRt۲ برنامه R ژن­ های معنی­ داری که در داخل و یا ۱۵ کیلوباز بالا و پایین‎دست نشانگرهای معنی ­دار قرار داشتند، شناسایی شدند. در نهایت، آنالیز غنی ­سازی مجموعه ­های ژنی با برنامه برخط KOBAS با هدف شناسایی عملکرد بیولوژیکی ژن­ های نزدیک به مناطق انتخابی از طریق پایگاه ­های برخط GO، KEGG، Reactome، BioCyc و PANTHER انجام شد. یافته ­ها: در این پژوهش تعداد ۱۱ نشانگر تک نوکلئوتیدی روی کروموزوم­ های ۱، ۲، ۵، ۷، ۸، ۱۰، ۱۳، ۱۵، ۱۷، ۲۲ و ۲۳ شناسایی شدند. در این مناطق ژن­ های QULP۱،AURKA،TEX۱۲،DLG۱T،ACVR۱، LCP۲ و PPFIA۲ که با صفات تولیدمثلی در ارتباط هستند، قرار داشتند. برخی از این ژن­های شناسایی شده در این تحقیق با مطالعات قبلی هم‎خوانی داشتند. در تحلیل غنی ­سازی مجموعه ­های ژنی، تعداد ۱۹ مسیر بیولوژیکی مرتبط با صفات تولید مثلی شناسایی شدند. برخی از مسیرهای زیستی شناسایی شده در باروری، نرخ تخمک‎اندازی، بیوسنتز استروژن، نرخ آبستنی، رشد و توسعه عضلات اسکلتی، رشد ابتدایی جنین و سن بلوغ نقش مهمی دارند. نتیج هگیری: ‎ نتایج حاصل از این تحقیق می­ تواند نقش مکانیسم های ژنتیکی موثر بر صفات تولید مثلی بیشتر آشکار سازد. با توجه به تایید مناطق قبلی پویش ژنومی و نیز شناسایی مناطق ژنومی جدید در این مطالعه، می توان با اطمینان بیشتراز یافته­‎های این پژوهش در برنامه های اصلاح نژادی برای صفات اقتصادی مهم در گوسفند استفاده نمود.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

حسین محمدی

Department of Animal Sciences, Faculty of Agriculture and Natural Resources, Arak University, Arak, Iran

محمد شمس اللهی

Department of Animal Sciences, Faculty of Agriculture, University of Ilam, Ilam, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abdoli, R., Zamani, P., Mirhosseini, S. Z., Ghavi Hossein-Zadeh, N., ...
  • Bezdicek, J., Stadnik, L., & Louda, F. (۲۰۱۵). The influence ...
  • Boroujeni, P.B., Sabbaghian, M., Totonchi, M., Sodeifi, N., Sarkardeh, H., ...
  • Bu, D., Luo, H., Huo, P., Wang, Z., Zhang, S., ...
  • Clancey, E., Kiser, J. N., Moraes, J. G. N., Dalton, ...
  • Cochran, S. D., Cole, J. B., Null, D. J., & ...
  • Durinck, S., Spellman, P. T., Birney, E., & Huber, W. ...
  • Dadousis, C., Pegolo, S., Rosa, G. J. M., Gianola, D., ...
  • Esmaeili-Fard, S. M., Gholizadeh, M., Hafezian, S. H., & Abdollahi-Arpanahi, ...
  • Fernández, J. C., Pérez, J. E., Herrera, N., Martínez, R., ...
  • Gholizadeh, M., & Esmaeili-Fard, S. M. (۲۰۲۲). Multi-population joint genome-wide ...
  • Ghiasi, H., & Abdollahi-Arpanahi, R. (۲۰۲۱). The candidate genes and ...
  • Hernández-Montiel, W., Martínez-Núñez, M. A., Ramón-Ugalde, J. P., Román-Ponce, S. ...
  • Hinrichs, A. L., Larkin, E. K., & Suarez, B. K. ...
  • Khaltabadi Farahani, A. H., mohammadi, H., & Moradi, H. (۲۰۲۰). ...
  • Johnston, S. E., McEwan, J. C., Pickering, N. K., Kijas, ...
  • Luo, N., Cheng, W., Zhou, Y., Gu, B., Zhao, Z., ...
  • Marjanovic, J., & Calus. M. P. L. (۲۰۲۰). Factors affecting ...
  • McBride, D., Carré, W., Sontakke, S. D., Hogg, C. O., ...
  • Menezo, Y. J., Silvestris, E., Dale, B., & Elder, K. ...
  • Mohammadi, H., Najafi, A., & Javanmard, A. (۲۰۲۲). Genome-wide Association ...
  • Mohammadabadi, M., Bordbar, F., Jensen, J., Du, M., & Guo, ...
  • Moosanezhad Khabisi, M., Esmailizadeh, A., & Asadi Fozi, M. (۲۰۲۲). ...
  • Mota, L. F. M., Lopes, F. B., Fernandes, G. A., ...
  • Ortega, M. S., Denicol, A. C., Cole, J. B., Null, ...
  • Purcell, S., Neale, B., Todd-Brown, K., Thomas, L., Ferreira, M. ...
  • Salazar-Carranza, M., Castillo-Badilla, G., Murillo-Herrera, J., Hueckmann-Voss, F., & Romero-Zúñiga, ...
  • Tsartsianidou, V., Pavlidis, A., Tosiou, E., Arsenos, G., Banos, G., ...
  • Wang, L., Jia, P., & Wolfinger, R. D. (۲۰۱۱). Gene ...
  • Wang, K., Liu, X., Qi, T., Hui, Y., Yan, H., ...
  • Xu, S. S., Gao, L., Xie, X. L., Ren, Y. ...
  • Young, M. D., Wakefield, M. J., Smyth, G. K., & ...
  • Zhou, X., & Stephens, M. (۲۰۱۲). Genome-wide efficient mixed-model analysis ...
  • Zhang, Y. E. (۲۰۱۷). Non-Smad signaling pathways of the TGF- ...
  • Abdoli, R., Zamani, P., Mirhosseini, S. Z., Ghavi Hossein-Zadeh, N., ...
  • Bezdicek, J., Stadnik, L., & Louda, F. (۲۰۱۵). The influence ...
  • Boroujeni, P.B., Sabbaghian, M., Totonchi, M., Sodeifi, N., Sarkardeh, H., ...
  • Bu, D., Luo, H., Huo, P., Wang, Z., Zhang, S., ...
  • Clancey, E., Kiser, J. N., Moraes, J. G. N., Dalton, ...
  • Cochran, S. D., Cole, J. B., Null, D. J., & ...
  • Durinck, S., Spellman, P. T., Birney, E., & Huber, W. ...
  • Dadousis, C., Pegolo, S., Rosa, G. J. M., Gianola, D., ...
  • Esmaeili-Fard, S. M., Gholizadeh, M., Hafezian, S. H., & Abdollahi-Arpanahi, ...
  • Fernández, J. C., Pérez, J. E., Herrera, N., Martínez, R., ...
  • Gholizadeh, M., & Esmaeili-Fard, S. M. (۲۰۲۲). Multi-population joint genome-wide ...
  • Ghiasi, H., & Abdollahi-Arpanahi, R. (۲۰۲۱). The candidate genes and ...
  • Hernández-Montiel, W., Martínez-Núñez, M. A., Ramón-Ugalde, J. P., Román-Ponce, S. ...
  • Hinrichs, A. L., Larkin, E. K., & Suarez, B. K. ...
  • Khaltabadi Farahani, A. H., mohammadi, H., & Moradi, H. (۲۰۲۰). ...
  • Johnston, S. E., McEwan, J. C., Pickering, N. K., Kijas, ...
  • Luo, N., Cheng, W., Zhou, Y., Gu, B., Zhao, Z., ...
  • Marjanovic, J., & Calus. M. P. L. (۲۰۲۰). Factors affecting ...
  • McBride, D., Carré, W., Sontakke, S. D., Hogg, C. O., ...
  • Menezo, Y. J., Silvestris, E., Dale, B., & Elder, K. ...
  • Mohammadi, H., Najafi, A., & Javanmard, A. (۲۰۲۲). Genome-wide Association ...
  • Mohammadabadi, M., Bordbar, F., Jensen, J., Du, M., & Guo, ...
  • Moosanezhad Khabisi, M., Esmailizadeh, A., & Asadi Fozi, M. (۲۰۲۲). ...
  • Mota, L. F. M., Lopes, F. B., Fernandes, G. A., ...
  • Ortega, M. S., Denicol, A. C., Cole, J. B., Null, ...
  • Purcell, S., Neale, B., Todd-Brown, K., Thomas, L., Ferreira, M. ...
  • Salazar-Carranza, M., Castillo-Badilla, G., Murillo-Herrera, J., Hueckmann-Voss, F., & Romero-Zúñiga, ...
  • Tsartsianidou, V., Pavlidis, A., Tosiou, E., Arsenos, G., Banos, G., ...
  • Wang, L., Jia, P., & Wolfinger, R. D. (۲۰۱۱). Gene ...
  • Wang, K., Liu, X., Qi, T., Hui, Y., Yan, H., ...
  • Xu, S. S., Gao, L., Xie, X. L., Ren, Y. ...
  • Young, M. D., Wakefield, M. J., Smyth, G. K., & ...
  • Zhou, X., & Stephens, M. (۲۰۱۲). Genome-wide efficient mixed-model analysis ...
  • Zhang, Y. E. (۲۰۱۷). Non-Smad signaling pathways of the TGF- ...
    • نمایش کامل مراجع