مطالعه بیوانفورماتیکی پروتئین مولتی اپی توپ طراحی شده بر اساس مناطق بسیار محافظت شده پروتئین هماگلوتینین سویه های H۹N۲ و H۵N۸ ویروس آنفولانزا

واکسیناسیون علیه آنفلوانزای پرندگانH۹N۲/H۵N۸   به عنوان یک راهکار موثر برای مقابله و کنترل این پاتوژن های کشنده مطرح می باشد. به همین منظور در این مطالعه یک واکسن کایمریک دوگانه موثر علیه H۹/H۵ از ناحیه HA۲ دوسویه H۹N۲ و H۵N۸ طراحی شد و با استفاده از مدل های بیوانفورماتیک، خصوصیات فیزیکوشیمیایی و تجزیه و تحلیل ساختار آنتی ژنیک اپی توپ های انتخاب شده مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. برای انجام این مطالعه سویه های (A/chicken/Iran/B۳۰۸B/۲۰۰۴)  H۹N۲ و (A/Poultry/Iran/clade ۲۳۴۴/۲۰۱۸)  H۵N۸ انتخاب شدند و اپی توپ های محرک لنفوسیت های B  و T بررسی و مناسب ترین آنها انتخاب شدند. سپس یک واکسن کایمریک با ترکیب اپی توپهای بسیار ایمنی زا طراحی شد. در ادامه با استفاده از نرم افزارهای مرتبط، ویژگیهای فیزیکوشیمیایی و ساختار ثانویه واکسن طراحی شده از لحاظ پایداری حرارتی و آبدوستی و  pH ایزوالکتریک و میزان آنتی ژنسیتی،آلرژنسیتی نیز مورد ارزیابی قرار گرفت. در نهایت واکسن پیشنهادی رونویسی معکوس شد و به منظور قرارگیری در وکتور بیانی پروکاریوتی PET ۴۱ a(+) تطبیق داده شد. با توجه به نتایج حاصل، پیش بینی میشود که ساختارآنتی ژنیک طراحی شده در این مطالعه می تواند با موفقیت و به میزان قابل قبولی در سیستم های پروکاریوتی بیان شود و جهت مطالعات ایمنی زایی علیه سویه های H۵N۸ وH۹N۲  ویروس آنفلوآنزا مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه ها:

ویروس آنفلوانزا ، مولتی اپی توپ ، هماگلوتینین ، بیوانفورماتیک