پیش بینی برهمکنش های پروتئین-پروتئین با استفاده از روش PPHGS-SVM
محل انتشار: یازدهمین کنفرانس سراسری سیستم های هوشمند
سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 2,948
فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
ICS11_216
تاریخ نمایه سازی: 14 مهر 1392
چکیده مقاله:
پروتئین ها ماکرومولکول هایی هستند که در اکثر فرایند های درون سلول نقش دارند. از قبیل انتقال، تنظیم هورمونی، سوخت و ساز بدن، تنفس و کنترل ژن ها. از طرفی اطلاعات برهم کنش های پروتئین-پروتئین که توسط فناوری های آزمایشگاهی با توان عملیاتی بالا استخراج می شوند اغلب ناکاملو نویزی می باشند. بنابراین گسترش روش های محاسباتی و داشتن مجموعه داده های برهم کنش با کیفیت بالا، برای پیش بینی برهم کنش های پروتئین-پروتئین ضروری است. هدف از این مقاله ارائه روشی برای بالابردن دقت پیش بینی برهمکنش ها می باشد. به منظور رسیدن به این هدف، روش PPHGS-SVM را پیشنهاد داده ایم که بر روی یک مجموعه داده تجمیعی اعمال شده است. بنابراین در این مقاله، از روش PCA برای کاهش ابعاد مجموعه داده استفاده کرده ایم تا با استخراج ویژگی های مهم آن، هم زمان پردازش را کم کنیم و هم دقت پیش بینی را افزایش دهیم. همچنین از روش PHGS به منظور انتخاب مناسب پارامتر ها برای دسته بند SVM بهره برده ایم و توانستیم دقت پیش بینی برهمکنش های پروتئین-پروتئین را از 5.17 % به . 5715 %بهبود دهیم. نتایج به دست آمده نشان می دهد که روش ارائه شده نسبت به روش های قبلی کارایی بهتری دارد
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سعیده محمودیان
دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر، دانشگاه تربیت مدرس
عبدالعزیز یوسف
دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر، دانشگاه تربیت مدرس
نصرالله مقدم چرکری
دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر، دانشگاه تربیت مدرس
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :