بررسی فیلوژنتیک سرده Onosma L . (تیره Boraginaceae s.str) با استفاده از توالی کلروپلاستی trnH-psbA
محل انتشار: کنگره ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی
سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 580
نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
IBRC01_093
تاریخ نمایه سازی: 5 مهر 1393
چکیده مقاله:
در فلور ایران 41 سرده و 218 گونه از تیره s.str. Boraginaceae معرفیشده است. Onosma بزرگترین سرده در تیره Boraginaceae s.str . با150 گونه در نواحی مدیترانه و غرب آسیا پراکندگی دارد). Cecchi et al2011 (. این سرده در ایران دارای 39 گونه است و بر اساس مشخصاتریخت شناسی به 3 بخشه تقسیم می شود , Khatamsaz 2002Attar & Jouharchi 2006, Attar 2007 . بخشه ProtonoasmaOnosma rostellata بخشه Podonosma Onosma orientalis وبخشه Onosma که دارای 3 زیر بخشه و 37 سرده در ایران می باشد. دراین تحقیق برای اولین بار 20 گونه از بخشه Onosma به همراه 1 گونهاز سرده Echium به عنوان برون گروه مورد آنالیز با توالی کلروپلاستیقرار گرفت. ناحیه trnH- - psbA برای مطالعات فیلوژنت کیی بسیار موردتوجه است زیرا این منطقه در پائین دست ناحیه trnK-matK واقع شدهو کیی از فاصله انداز های است که تنوع ژنت کیی بالایی دارد، از مزایایفاصله انداز این است که نمونه های هرباریومی با محتوای ژنومی خرد شدهبه آسانی قابل تکثیر هستند ) Stech and Quandt 2010 (.توالی موردنظر با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز به همراه پرایمرهای همگانیمربوطه تکثیر شد. منطقه تکثیر شده توالی یابی گردید و به کمک برنامهMuscle همردیف سازی شدند. بازسازی فیلوژنی با استفاده از مدلتکاملی GTR + I و روش Bayesian تعبیه شده در نرم افزار Mrbayesانجام گرفت. درخت فیلوژنی حاصل از توالی trnH-psbA نشان می دهدگونه های بخشه Onosma از سرده Onosma در ایران با حمایت بالاتک تبار هستند ولی گونه ها در 3 کلاد به صورت تریتومی قرار می گیرند.آنالیزها نشان م یدهد زیر بخشه های Haplotricha, Heterotricha وAsterotricha در بخشه Onosma تک تبار نیستند و صفت کرک درتقسی مبند یها مصنوعی است.
کلیدواژه ها:
سرده Onosma توالی trnH-psbA فیلوژنی مولکولی
نویسندگان
نسیم سعادتی
گروه علوم گیاهی دانشگاه تربیت مدرس تهران
شاهرخ کاظم پور اوصالو
گروه علوم گیاهی دانشگاه تربیت مدرس تهران
علی اصغر معصومی
موسسه تحقیقاتی جنگل ها و مراتع تهران